高同源區(qū)段SNP分型/重測序

上海翼和生物基于自主知識產(chǎn)權(quán)的多重 PCR 捕獲技術(shù)，結(jié)合特色的生信分
析方法，開發(fā)了基于多重 PCR 的多倍體擴(kuò)增子測序 SNP 分型，提高了 SNP
分型的準(zhǔn)確度。二代測序得到單分子序列信息，通過特色生信分析方法，對混合
結(jié)果進(jìn)行有效拆分，準(zhǔn)確地將測序 reads 比對到亞基因組，拆分亞基因組同原序
列，排除 PSV 和 HSV 的干擾，從而對多倍體物種進(jìn)行 SNP 分型。

snp分型
詢價(jià)

上海翼和生物基于自主知識產(chǎn)權(quán)的多重 PCR 捕獲技術(shù)，結(jié)合特色的生信分析方法，開發(fā)了基于多重 PCR 的多倍體擴(kuò)增子測序 SNP 分型，提高了 SNP分型的準(zhǔn)確度。二代測序得到單分子序列信息，通過特色生信分析方法，對混合結(jié)果進(jìn)行有效拆分，準(zhǔn)確地將測序 reads 比對到亞基因組，拆分亞基因組同原序列，排除 PSV 和 HSV 的干擾，從而對多倍體物種進(jìn)行 SNP 分型。

應(yīng)用方向

農(nóng)口：全基因組 SNP 基因型分析；QTL 定位及基因定位；發(fā)現(xiàn)優(yōu)良等位變異；開發(fā)功能標(biāo)記；定制育種 Panel；分子標(biāo)記輔助選擇育種；遺傳材料前景及背景選擇；全基因組選擇；親緣關(guān)系鑒定、DNA 指紋圖譜、品種鑒定；遺傳多樣性評價(jià)；群體遺傳結(jié)構(gòu)分析。

技術(shù)原理

上海翼和高同源區(qū)段 SNP 分型，結(jié)合多重 PCR 技術(shù)和高通量測序技術(shù)，對需要檢測的位點(diǎn)設(shè)計(jì)特異性引物，在單管內(nèi)進(jìn)行多重 PCR 擴(kuò)增，不同的樣本以不同的 Barcode 引物區(qū)分，對擴(kuò)增子進(jìn)行高通量測序。測序結(jié)果使用生物信息學(xué)方法，區(qū)分丌同的樣本。并且將多倍體的丌同基因組進(jìn)行拆分后，對測序短序列進(jìn)行精準(zhǔn) reads mapping，剔除 HSV 和 PSV 干擾，最終獲得每個(gè)位點(diǎn)準(zhǔn)確的分型信息。