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大小鼠遺傳質(zhì)量鑒定

翼和生物針對(duì)小鼠近交系和封閉群,從國(guó)際金標(biāo)準(zhǔn)Jackson實(shí)驗(yàn)室2000個(gè)SNP位點(diǎn)中優(yōu)選出150個(gè)SNP位點(diǎn),采用多重PCR擴(kuò)增建庫(kù)技術(shù)結(jié)合二代高通量測(cè)序進(jìn)行SNP基因分型,并自寫軟件與Jackson數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行比對(duì)。優(yōu)選后的150個(gè)SNP標(biāo)記,可準(zhǔn)確鑒別所有近交系小鼠,品系兩兩間關(guān)系最近的相差3個(gè)SNP,關(guān)系最遠(yuǎn)的相差73個(gè)SNP,差異位點(diǎn)平均數(shù)為53個(gè)。優(yōu)選后,大幅度降低成本的同時(shí)保證了鑒定結(jié)果準(zhǔn)確性。
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實(shí)驗(yàn)動(dòng)物簡(jiǎn)介

實(shí)驗(yàn)動(dòng)物是具有明確遺傳背景并嚴(yán)格遺傳控制的動(dòng)物,是人類醫(yī)學(xué)研究的重要工具之一,包括小鼠、大鼠、猴、兔、犬、豬、雞、地鼠、貓和豚鼠等多個(gè)物種,其中小鼠和大鼠為最常用的實(shí)驗(yàn)動(dòng)物。

根據(jù)遺傳特點(diǎn)的不同,實(shí)驗(yàn)動(dòng)物分為近交系、封閉群和雜交群

    


最常用的大小鼠近交系、封閉群

     


大小鼠遺傳質(zhì)量鑒定

實(shí)驗(yàn)動(dòng)物具有明確遺傳背景,并需要進(jìn)行遺傳控制,否則遺傳因素會(huì)干擾實(shí)驗(yàn)結(jié)果。很多生命科學(xué)的研究,要求實(shí)驗(yàn)動(dòng)物的遺傳結(jié)構(gòu)有較高的同一性、穩(wěn)定性和純合度。這就提出了實(shí)驗(yàn)動(dòng)物的遺傳質(zhì)量和監(jiān)測(cè)的問題。每年進(jìn)行遺傳質(zhì)量鑒定是非常必要的。導(dǎo)致實(shí)驗(yàn)動(dòng)物不合格的主要是以下3個(gè)方面:

1.在繁殖飼養(yǎng)過程中,多個(gè)不同品系混養(yǎng),可能會(huì)發(fā)生錯(cuò)誤標(biāo)記;

2.自身突變積累,導(dǎo)致遺傳特性漸漸與早期世代品系有差異;

3.封閉群繁育過程中,親本選配組合不當(dāng)造成近交化。

現(xiàn)行的實(shí)驗(yàn)動(dòng)物遺傳質(zhì)量控制的國(guó)家標(biāo)準(zhǔn)為《GB14923-2010 實(shí)驗(yàn)動(dòng)物 哺乳類實(shí)驗(yàn)動(dòng)物的遺傳質(zhì)量控制》,國(guó)標(biāo)中規(guī)定了實(shí)驗(yàn)動(dòng)物近交系和封閉群需定期(每年一次)進(jìn)行遺傳檢測(cè),確保遺傳質(zhì)量。


國(guó)標(biāo)GB14923-2010提及的遺傳質(zhì)量檢測(cè)方法

         


目前針對(duì)大小鼠遺傳質(zhì)量鑒定,除了國(guó)標(biāo)GB14923-2010外,主要參考中國(guó)實(shí)驗(yàn)動(dòng)物學(xué)會(huì)團(tuán)體標(biāo)準(zhǔn)《T/CALAS21-2017 實(shí)驗(yàn)動(dòng)物 小鼠、大鼠微衛(wèi)星DNA標(biāo)記檢測(cè)方法》。該團(tuán)體標(biāo)準(zhǔn)由中國(guó)實(shí)驗(yàn)動(dòng)物學(xué)會(huì)實(shí)驗(yàn)動(dòng)物標(biāo)準(zhǔn)化專業(yè)委員會(huì)提出并組織,由中國(guó)食品藥品檢定研究院、首都醫(yī)科大學(xué)和浙江省醫(yī)學(xué)科學(xué)院共同起草完成。該標(biāo)準(zhǔn)明確規(guī)定了大小鼠遺傳質(zhì)量鑒定的STR方案。新國(guó)標(biāo)制訂計(jì)劃《實(shí)驗(yàn)動(dòng)物 近交系小鼠、大鼠SNP標(biāo)記檢測(cè)法》已經(jīng)于20201119日下達(dá),并由中國(guó)食品藥品檢定研究院和上海實(shí)驗(yàn)動(dòng)物研究中心共同起草,目前處于起草階段。



多重PCR&二代高通量測(cè)序助力小鼠遺傳質(zhì)量鑒定

翼和生物針對(duì)小鼠近交系和封閉群,從國(guó)際金標(biāo)準(zhǔn)Jackson實(shí)驗(yàn)室2000個(gè)SNP位點(diǎn)中優(yōu)選出150個(gè)SNP位點(diǎn),采用多重PCR擴(kuò)增建庫(kù)技術(shù)結(jié)合二代高通量測(cè)序進(jìn)行SNP基因分型,并自寫軟件與Jackson數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行比對(duì)。優(yōu)選后的150個(gè)SNP標(biāo)記,可準(zhǔn)確鑒別所有近交系小鼠,品系兩兩間關(guān)系最近的相差3個(gè)SNP,關(guān)系最遠(yuǎn)的相差73個(gè)SNP,差異位點(diǎn)平均數(shù)為53個(gè)。優(yōu)選后,大幅度降低成本的同時(shí)保證了鑒定結(jié)果準(zhǔn)確性。


多重?zé)晒?span style="margin: 0px; padding: 0px; outline: 0px; max-width: 100%; font-family: Calibri; box-sizing: border-box !important; overflow-wrap: break-word !important;">PCR&ABI3730平臺(tái)STR基因分型助力大鼠遺傳質(zhì)量鑒定

Biowing大鼠近交系和封閉群的遺傳質(zhì)量鑒定服務(wù),參照?qǐng)F(tuán)標(biāo)《T/CALAS21-2017 實(shí)驗(yàn)動(dòng)物 小鼠、大鼠微衛(wèi)星DNA標(biāo)記檢測(cè)方法》提供的STR引物方案,結(jié)合翼和生物多重PCR技術(shù)優(yōu)勢(shì),進(jìn)行多重?zé)晒?span style="margin: 0px; padding: 0px; outline: 0px; max-width: 100%; box-sizing: border-box !important; overflow-wrap: break-word !important; font-family: Calibri;">PCRSTR分型,獲得樣本STR分型后,利用遺傳學(xué)分析軟件計(jì)算群體遺傳參數(shù),依據(jù)團(tuán)標(biāo)T/CALAS21-2017的標(biāo)準(zhǔn)判斷大鼠近交系和封閉群是否合格。

    


送檢流程與周期

大小鼠遺傳質(zhì)量鑒定檢測(cè)周期:2-3周。


    






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