【產(chǎn)品規(guī)格】
該產(chǎn)品為已純化的基因組DNA,用于 qPCR 標(biāo)準(zhǔn)曲線的繪制和校正系數(shù)的計(jì)算。
低溫冷凍運(yùn)輸,-20℃保存,有效期6個(gè)月。
標(biāo)準(zhǔn)品和校正品先12000 rpm離心5 min,離心后小心開(kāi)啟,每管再分別用60 μL RNase Free Water復(fù)溶。使用時(shí)請(qǐng)上下輕柔顛倒十次混勻,避免起泡,并低速短暫離心后使用。
1、qPCR 標(biāo)準(zhǔn)曲線的繪制
1.1 標(biāo)準(zhǔn)品質(zhì)量的標(biāo)化
標(biāo)準(zhǔn)品DNA和校正品DNA經(jīng)DNA純化液純化后,用DNA分選磁珠進(jìn)行分選,具體操作步驟見(jiàn)端粒長(zhǎng)度DNA純化試劑盒說(shuō)明書(shū)(TL50-P)。
1.2 標(biāo)準(zhǔn)品濃度的稀釋
DNA磁珠分選后的標(biāo)準(zhǔn)品中的DNA標(biāo)化為8 ng/μL,體積為40 μL(標(biāo)為管1),從管1中吸取20 μL,加入到管2中,另外加入20 μL RNase Free Water(客戶自備)
得到溶液2;在管3中加入20 μL溶液2,另外加入20 μL RNase Free Water得到溶液3。連續(xù)的稀釋方法得到標(biāo)準(zhǔn)曲線R2可達(dá)到0.99左右。
1.3 校正品濃度的稀釋
DNA磁珠分選后的校正品中的DNA標(biāo)化為4 ng/μL,體積為20 μL。
2、加樣
各反應(yīng)孔加樣示例
3、結(jié)果與計(jì)算
3.1 標(biāo)準(zhǔn)曲線的構(gòu)建
以標(biāo)準(zhǔn)品3個(gè) 濃度梯度下的平均 Ct值為橫坐標(biāo) , 3個(gè)梯度 的 Log2上樣量為縱坐標(biāo),構(gòu)建標(biāo)準(zhǔn)曲線圖示:
表1 標(biāo)準(zhǔn)品端粒通道Ct值
表2 標(biāo)準(zhǔn)品內(nèi)參通道Ct值
3.2 利用標(biāo)準(zhǔn)品標(biāo)準(zhǔn)曲線計(jì)算校正品的T/S
將校正品的端粒和內(nèi)參通道的Ct 值代入標(biāo)準(zhǔn)曲線方程,即可得到校正品的T/S。
表3 校正品的T/S計(jì)算過(guò)程
3.3 校正系數(shù)的計(jì)算
已對(duì)標(biāo)準(zhǔn)品和校正品的端粒長(zhǎng)度做TRF檢測(cè),絕對(duì)端粒長(zhǎng)度已知(假定標(biāo)準(zhǔn)品的絕對(duì)長(zhǎng)度為5430 bp,校正品的絕對(duì)長(zhǎng)度為5100 bp),按照下圖示即可得到 用于校正樣品的校正系數(shù)。
表4 校正品的校正系數(shù)
3.4 樣本T/S以及絕對(duì)長(zhǎng)度的計(jì)算
表5 樣本的T/S計(jì)算
本表中校正系數(shù)源自表4中計(jì)算出的校正系數(shù),本表中標(biāo)準(zhǔn)品絕對(duì)長(zhǎng)度為5430 bp。
注:樣品及標(biāo)準(zhǔn)品濃度過(guò)高或過(guò)低會(huì)影響擴(kuò)增效率,對(duì)實(shí)驗(yàn)造成干擾,測(cè)量結(jié)果誤差較大。
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